鑑於全球化經濟及數位科技之發展，跨境交易態樣愈趨複雜，外國營利事業跨境專利授權提供國內營利事業使用而獲取以外幣計酬之權利金，已屬普遍。實務上，扣繳義務人（國內營利事業）在給付前述權利金時，應以原給付之外幣按「當時匯率」換算成新臺幣，再依適用之扣繳率計算應扣繳稅款，並完成扣繳申報。 

然而，若嗣後交易雙方協議退還部分報酬，所衍生之溢扣繳稅款應如何計算？ 

財政部國稅局特別提醒，在此情況下，扣繳義務人申請退還之溢扣繳稅款，應依「退還之外幣/原給付之外幣」比例乘算「原扣繳稅款」計算可退還之稅款，而非逕以退還之外幣金額按「當時滙率」換算成新臺幣再乘算「適用之扣繳率」計算溢扣稅款。計算式如下： 

可退還稅款=原扣繳稅款（新臺幣）*(退還之外幣金額)/(原給付之外幣金額) 

例如：115年間境外日商營利事業乙公司授權專利予境內營利事業甲公司使用，雙方約定報酬為日幣10,000,000元，甲公司以給付金額按當時匯率0.2換算為新臺幣（以下同）2,000,000元（日幣10,000,000元X0.2），應扣繳稅款400,000元（2,000,000元X扣繳率20%）並完成扣繳申報。嗣後，因故雙方協議退還部分權利金日幣500,000元，致產生溢扣繳稅款20,000元【400,000元X（日幣500,000元/10,000,000元）】，惟甲公司逕以退還之日幣按當時匯率0.25換算新臺幣再乘算扣繳率，申請退還溢扣繳稅款25,000元（日幣500,000元X0.25X扣繳率20%），致退稅金額計算錯誤。 

該局提醒，扣繳單位應注意扣繳相關規定並正確計算扣繳稅款，如有誤扣或溢扣稅款，可檢附扣繳稅款繳款書正本及相關證明文件向國稅局申請退還，或於同年度應扣繳稅款內留抵。本所建議扣繳單位應建立稅務預審機制或諮詢會計師協助試算，以確保合規並控管風險。